В 1981 году поступил на радиотехнический факультет Рыбинского авиационного технологического института (ныне – федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Рыбинский государственный авиационный технический университет имени П. А. Соловьева»). После окончания вуза с 1986 года работал в нем на должностях инженера НИС, начальника комплекса кафедры «Технология авиационных двигателей и общего машиностроения» (ТАД и ОМ). Окончил заочную аспирантуру и был принят на преподавательскую работу в должности ассистента кафедры ТАД и ОМ. В 1997 году защитил диссертацию на соискание ученой степени кандидата технических наук на тему «Автоматизированное управление процессом токарной обработки на основе энергетического критерия резания с целью обеспечения качества поверхностного слоя и точности изготовления деталей авиационных двигателей». В 1997 году был переведен на должность старшего преподавателя, а в 1998 году – на должность доцента кафедры ТАД и ОМ. С 2003 г. по 2006 г. проходил обучение в докторантуре. В 2007 году защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора технических наук на тему «Повышение эффективности наукоемких производств на основе системного анализа, моделирования и оптимизации процессов менеджмента качества». С 2007 года руководит кафедрой «Организация производства и управление качеством».

Автор более 160 публикаций, в том числе 10 учебных пособий, более 50 научных статей в журналах, аннотируемых ВАК РФ, SCOPUS и Web of Science.

Э. В. Киселев с 2015г. является экспертом Федеральной службы по надзору в сфере образования и науки при проведении аккредитационной экспертизы высших учебных заведений, в том числе по программам подготовки кадров высшей квалификации.